Masalah Yang Muncul Adanya Otonomi Daerah

Berbagai permasalahan tersebut antara lain:
1. Kurang siapnya berbagai pihak menerima perubahan.
2. Belum tersedianya aturan yang mengatur pelaksanaan ditingkat daerah.
3. Besarnya kekuasaan Kepala Daerah memungkinkan timbulnya KKN di tingkat daerah.
4. Tidak adanya komunikasi antara Kepala Daerah dan Lembaga Legislatif dengan masyarakat menimbulkan permasalahan baru.
5. Masih banyak kabupaten yang memiliki kemampuan rendah di dalam menggali perolehan Pendapatan Asli Daerah(PAD) sehingga ketergantungan kepada pemerintah pusat masih tinggi.
6. Dalam penggali PAD, daerah berusaha mendapatkan sebanyak-banyaknya. Hal ini bisa menimbulkan konflik apabila tidak ada koordinasi yang baik.
7. Perbedaan sumber daya manusia dan alam akan menjadikan perbedaan dalam memberikan pelayanan antara daerah satu dengan daerah lain. Hal ini menimbulkan kecemburuan antar daerah.
8. Dalam pemekaran wilayah sering terjadi pro dan kontra sehingga sering pula terjadi bentrokan-bentrokan.